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双组分小分子自组装的动态演化
图摘要
摘要
从一个双组分体系的有限轨迹追踪聚集过程，比较形貌、接触网络和相对稳定阶段。图摘要串联聚集快照、结构指标与构象分布，呈现组装过程中的主要状态演化。多项结果共同形成对聚集路径、关键接触和代表构象的直观认识。
计算结果
结果和讨论
图 2. 候选化合物 B和候选化合物 A在 100 ns 分子动力学模拟过程中的结构与相互作用分析结果。(A)体系整体 RMSD 随时间变化;(B)体系回旋半径(Rg)随时间变化;(C)代表性原子对的径向分布函数 g(r);(D)体系中氢键(HBonds)、π-π作用数量随时间的变化;(E)短程范德华(van der Waals, SR)与静电(Coulomb, SR)相互作用能随时间的变化;(F)体系溶剂可及表面积(SASA)随时间变化。
该图呈现“结果和讨论”中的主要结构与趋势，并与本案例的候选排序和结果判断形成对应。
HS-CASE-0011
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