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单细胞网络虚拟敲除与状态扰动分析
图摘要
摘要
从单细胞表达数据构建条件网络，通过虚拟扰动比较细胞状态偏移、网络响应与功能富集，生成实验优先级。图摘要整合数据分布、模型响应与特征比较，集中呈现跨分析层的一致趋势。这些结果形成清晰的特征、扰动或生物标志物优先级。
计算结果
图4|雌性阶段 靶标 D 虚拟敲除
a,各雌性阶段中雄性和雌性程序基因的中位log2(1+调控效应FC),并与表达率和网络出度匹配的中性基因敲除比较。b,核心性别基因的种子间中位效应。误差范围表示三个随机种子的四分位间距。
该图呈现“图4|雌性阶段 靶标 D 虚拟敲除”中的主要结构与趋势，并与本案例的候选排序和结果判断形成对应。
图5|雄性阶段 靶标 A 与 靶标 B 虚拟敲除
a,两个Dnmt3旁系同源基因对雌性和雄性程序的中位log2(1+调控效应FC)。b,核心性别基因的响应谱。效应FC表示流形空间距离相对于背景期望的倍数,而非表达倍数变化。
该图呈现“图5|雄性阶段 靶标 A 与 靶标 B 虚拟敲除”中的主要结构与趋势，并与本案例的候选排序和结果判断形成对应。
图6|靶标 C 敲除的阶段特异性效应
a,各阶段高响应基因的网络效应热图。b,最后雌性阶段与最早间性阶段的基因效应对应关系,用于识别转变期响应重排。
该图呈现“图6|靶标 C 敲除的阶段特异性效应”中的主要结构与趋势，并与本案例的候选排序和结果判断形成对应。
图7|随机种子与阴性对照稳健性
a,不同随机种子Top50高响应基因集合的Jaccard重叠。b,目标敲除与匹配中性基因敲除中FDR<0.05基因的比例。
该图呈现“图7|随机种子与阴性对照稳健性”中的主要结构与趋势，并与本案例的候选排序和结果判断形成对应。
HS-CASE-0008
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