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金属配合物候选的对接、动力学与能量复核
图摘要
摘要
从金属配合物参数准备出发，连续复核结合构象、采样稳定性、局部互作与近似能量趋势。图摘要集中展示代表构象、关键接触与组间比较，使不同互作模式的特征能够快速对应。多维结果共同形成构象优先级与可继续研究的相互作用线索。
计算结果
计算结果
图1. 靶标 A–候选化合物 A复合物的结合模式。(A) 蛋白与配体静电势表面及结合口袋示意;(B) 配体在 靶标 A 中的结合构象;(C) 局部相互作用图。
该图呈现“计算结果”中的主要结构与趋势，并与本案例的候选排序和结果判断形成对应。
图2. 靶标 A–候选化合物 A复合物的分子动力学模拟分析。(A) 配体RMSD;(B) 复合物RMSD;(C) 蛋白RMSD;(D) 回旋半径(Rg);(E) 溶剂可及表面积(SASA);(F) 配体与蛋白质质心距离;(G) 蛋白残基RMSF;(H) 关键氨基酸氢键占有率;(I) 氢键数量变化。
该图呈现“计算结果”中的主要结构与趋势，并与本案例的候选排序和结果判断形成对应。
图3. 靶标 A–候选化合物 A复合物构象随模拟时间的变化。
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HS-CASE-0033
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